home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Internet Info 1994 March / Internet Info CD-ROM (Walnut Creek) (March 1994).iso / inet / resource-guide / chapter.3 / section3-35.txt < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1992-11-05  |  5.5 KB  |  181 lines
  1.  
  2.  
  3.  
  4.  
  5.  
  6.  
  7.  
  8.                         EMBL - Data Library Network Servers
  9.  
  10.  
  11.             _A_d_d_r_e_s_s:
  12.                EMBL Data Library
  13.                European Molecular Biology Laboratory
  14.                Postfach 10.2209
  15.                W-6900 Heidelberg
  16.                Germany
  17.  
  18.             _E_m_a_i_l: NetHelp@EMBL-Heidelberg.DE
  19.  
  20.             _P_h_o_n_e: +49-6221-387 258
  21.                FAX: +49-6221-387 519
  22.  
  23.             _D_e_s_c_r_i_p_t_i_o_n
  24.  
  25.             The EMBL Data Library offers a range of electronic  services
  26.             to the molecular biology research community.
  27.  
  28.             An electronic mail server and an anonymous ftp server  allow
  29.             access  to  a  large  number  of important data collections,
  30.             including the EMBL nucleotide sequence database, the  SWISS-
  31.             PROT  protein  sequence database, and the Brookhaven protein
  32.             structure database. In addition  to  the  complete  quartely
  33.             releases  of  the  sequence  databases weekly updates of the
  34.             EMBL database are provided for downloading by  ftp.  Indivi-
  35.             dual EMBL database entries can be retrieved using the e-mail
  36.             server, and new entries are made available on a daily basis.
  37.  
  38.             The Data Library also maintains an archive of free  software
  39.             for  molecular biology. More than 200 different programs are
  40.             currently available for MS-DOS, Vax/VMS, UNIX and  Macintosh
  41.             systems and can be downloaded by e-mail or anonymous ftp.
  42.  
  43.             New data collections and software are added constantly.
  44.  
  45.             The FASTA and QuickSearch services enable  remote  users  to
  46.             perform  sequence  similarity  searches against a variety of
  47.             nucleotide and  protein  sequence  databases  maintained  at
  48.             EMBL. Whereas QuickSearch is appropriate for the quick iden-
  49.             tification of very similar database entries, FASTA is better
  50.             _________________________
  51.             The information in this section is provided  in  accor-
  52.             dance  with the copyright notice appearing at the front
  53.             of this guide.
  54.  
  55.  
  56.  
  57.  
  58.             September 21, 1992          NNSC       Section 3.35,  Page 1
  59.  
  60.  
  61.  
  62.  
  63.  
  64.  
  65.  
  66.  
  67.             suited  for  the  detection  of   more   distantly   related
  68.             sequences.  The  database available for searches are updated
  69.             daily,  thus  access  to  latest  sequence  information   is
  70.             guaranteed.
  71.  
  72.             A Gopher server (EMBnet BioInformation Resource EMBL) is  in
  73.             operation  which  sits  on  top  of  the  EMBL anonymous ftp
  74.             archive. It is part of the EMBnet BioGopher network.
  75.  
  76.             _N_e_t_w_o_r_k _A_c_c_e_s_s
  77.  
  78.             Anyone with direct or gatewayed access to the  Internet  can
  79.             use the EMBL servers.
  80.  
  81.             The addresses to use are:
  82.  
  83.                NetServ@EMBL-Heidelberg.DE
  84.                   (E-mail file server)
  85.  
  86.                Fasta@EMBL-Heidelberg.DE
  87.                   (FASTA database similarity searches)
  88.  
  89.                Quick@EMBL-Heidelberg.DE
  90.                   (QuickSearch database similarity searches)
  91.  
  92.             Detailed descriptions of access procedures and the  informa-
  93.             tion  available  can be obtained by sending the word HELP on
  94.             the Subject line or in the body of an e-mail message to  the
  95.             addresses shown above.
  96.  
  97.             The anonymous ftp server can be reached at:
  98.  
  99.                ftp.EMBL-heidelberg.DE
  100.  
  101.             Use the user name "anonymous" and  your  e-mail  address  as
  102.             password  to  log in.  Some older ftp clients might get con-
  103.             fused by multiple message lines. In this case, enter a  dash
  104.             "-"  as  the  first  character  of the password to turn this
  105.             feature off.
  106.  
  107.             The Gopher server can be accessed at  ftp.EMBL-Heidelberg.DE
  108.             at port 70.
  109.  
  110.             _W_h_o _C_a_n _U_s_e _T_h_e _E_M_B_L _S_e_r_v_e_r
  111.  
  112.             Access to the EMBL network services  is  unrestricted.  How-
  113.             ever,  European  users  are strongly encouraged to use their
  114.             national EMBnet nodes if possible. Most EMBnet  nodes  offer
  115.  
  116.  
  117.  
  118.             September 21, 1992          NNSC       Section 3.35,  Page 2
  119.  
  120.  
  121.  
  122.  
  123.  
  124.  
  125.  
  126.  
  127.             similar services.
  128.  
  129.             _M_i_s_c_e_l_l_a_n_e_o_u_s
  130.  
  131.             Periodically, the EMBL File Server Newsletter is  posted  to
  132.             the  USENET  newsgroup  bionet.molbio.embl-databank. It con-
  133.             tains information about changes and additions  to  the  ser-
  134.             vices  provided by the EMBL Data Library. This newsgroup can
  135.             also be used to contact the Data Library staff.
  136.  
  137.             The   EMBL   anonymous   ftp   server   is    mirrored    by
  138.             ftp.weizmann.ac.il.
  139.  
  140.             The software provided is exchanged with the file servers  at
  141.             the  University  of  Indiana  (Iubio)  and the University of
  142.             Houston (Gene-Server).
  143.  
  144.             These network services are provided  in  collaboration  with
  145.             the EMBL Computer Group.
  146.  
  147.             _R_e_f_e_r_e_n_c_e_s
  148.  
  149.             Additional information about these resources  are  available
  150.             by  electronic  mail  from  NetServ@EMBL-Heidelberg.DE (help
  151.             doc),  by  anonymous  ftp   (in   /pub/help   on   ftp.EMBL-
  152.             Heidelberg.DE) or by Gopher ("About this resource").
  153.  
  154.  
  155.  
  156.  
  157.  
  158.  
  159.  
  160.  
  161.  
  162.  
  163.  
  164.  
  165.  
  166.  
  167.  
  168.  
  169.  
  170.  
  171.  
  172.  
  173.  
  174.  
  175.  
  176.  
  177.  
  178.             September 21, 1992          NNSC       Section 3.35,  Page 3
  179.  
  180.  
  181.